asterix_gtsf1:eCLIP和RIP数据的脚本和处理协议 源码

Asterix / Gtsf1下一代测序数据处理 该文献伴随着描述蛋白质Asterix / Gtsf1在逆转录应答沉默中的作用的手稿。 可以根据以下描述的文件夹找到代码,处理和基因注释。 引文 Asterix / Gtsf1链接逆转座子的tRNA和piRNA沉默乔纳森·伊普萨罗(Jonathan J. Ipsaro),保罗·奥布莱恩(Paul A.O'Brien),什巴尼·巴塔查亚(Shibani Bhattacharya),亚瑟·G·帕尔默(Arthur G. Cell Rep.2021 Mar 30; 34(13):108914。 doi:10.1016 / j.celrep.2021.108914。 PMID:33789107 注解 小鼠mm10和果蝇dm6装配体的自定义基因注释 eCLIP 用于处理增强的交联IP数据集的脚本(包括鼠标和果蝇) 核糖核酸 从下拉实验中对RNA库进行