multipsq:多重焦磷酸测序实验中的热解图分析 开源

该软件可根据在Pyro-Mark ID系统(Qiagen)上执行的多重焦磷酸测序算法的结果对生物进行分类。 可以使用可从https://sourceforge.net/projects/mpsqed/获得的mpsqed软件设计分析方法。焦磷酸测序可用于基于单核苷酸多态性(SNP)的病原体分型或提供短DNA序列的序列信息。 但是,对于某些病原体,不能依靠单个SNP或短序列延伸来进行分子分型,因此必须考虑几个基因组区域。 一种有前途的快速方法是同时应用多种测序引物,称为多重焦磷酸测序。 这些引物生成指纹图谱,该图由来自所使用的每种引物的所有各个热解图的总和构成。 MultiPSQ允许对源自各种焦磷酸测序引物的多重色谱图进行分析和分类。