MPIGeneNet:构建基因共表达网络的并行工具 开源

MPIGeneNet是使用Pearson相关和随机矩阵理论(RMT)构建基因共表达网络的并行工具。 该工具将带有从多个样本中观察到的不同基因的表达值(浮点值)的矩阵作为输入。 它是RMTGenNet工具(https://github.com/spficklin/RMTGeneNet)的并行化。 MPIGeneNet将创建一个程序的整个过程集成在一起,这使该工具更易于使用(用户只需要启动一次应用程序),并且避免了从模块之间的中间文件进行写入/读取操作。