OSCA.workflows:OSCA书籍的工作流程 源码

OSCA书籍的工作流程 该存储库包含一个Bioconductor软件包,用于部署Orchestrating Single-Cell Analysis手册的Workflows子手册。 使用以下命令安装本书中使用的所有相关软件包: BiocManager :: install( remotes :: local_package_deps( dependencies = TRUE )) 可以通过在inst/book运行通常的bookdown调用来完成书籍的构建: bookdown :: render_book( " index.Rmd " ) 或通过R CMD build在包装本身上,以在小插图构建过程中编译该书。 要提交报告,请遵循标准过程:fork和PR。 这需要更新inst/rebook的文件,以支持来自外部软件包的链接。 更新通常由GitHub Action处理,但可以通过以下