EBT:进化生物信息学工具包(EBT) 源码

进化生物信息学工具包 大量的脚本为序列数据的进化分析提供了计算帮助。 内容 。 您要在基础核苷酸序列上进行氨基酸比对。 。 您有两组或更多组序列,它们彼此对齐但位于单独的FASTA文件中,并希望识别这些组表现出差异的位点。 您希望将对齐的核苷酸FASTA文件中每个变量位置的每个核苷酸的数量(和比例)制成表格。 。 您要计算两个核苷酸序列之间的p距离。 。 您想对所有k-mers进行比对,以获得一个比对的序列及其基因。 。 您要确定对齐的核苷酸FASTA文件的共有序列和/或IUPAC序列。 。 您想从带注释的VCF文件(例如,使用选项进行注释的文件)中提取密码子变体,以