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分子建模的计算技术 PoliMi分子建模计算技术课程的数值部分的项目-第一版,2021年Spring 团队 Luca Caivano(数学工程) 安德里亚·德拉·利伯拉(化学工程) 曼弗雷德·内斯蒂(数学工程) Valeria Pajola(化学工程) Alessandro Pegurri(化学工程) Bruno Ursino(数学工程) Chiara Vitale(化学工程) 作业1 用速度-Verlet方法作为一个积分器,实现一个保守的双摆的模拟器,并研究时间步长的轨迹和总能量的准确性。 重新格式化模型,以便使用SHAKE方法在笛卡尔坐标系中模拟约束。 将Velocity-Verlet方法应用于冻结的Argon晶体示例,如Hairer,Lubich,Wanner中的-几何数值积分-第I.4节。 作业2 重现Gabriel,Knapek,Zumbusch中的示例-分子