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Mini_Project 源码

上传者: 2021-04-26 13:54:05上传 ZIP文件 50.28MB 热度 16次
计算生物学迷你计划 安装 为了从您的工作目录运行此代码,请使用以下git命令将此存储库克隆到您的工作空间: git clone https://github.com/lmaskeri/Mini_Project.git 方向 您可以对整个数据集或测试数据集运行此代码。 运行测试数据集将使用从存储库中克隆的较小的fastq文件,而不是在包装器中下载并创建它们。 要运行测试数据集,请使用以下命令: python3 mini_wrapper.py test_dataset 要使用所有成对的读取来运行整个数据集,请使用以下命令: python2 mini_wrapper.py whole_dataset 包含的脚本 mini_wrapper.py sleuth_script.R MiniProject.log输出详细信息 HCMV基因组(EF999921)中CDS的数量。 在两个时间点(2
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