lsh_scripts 源码

访问用于CONSULT基准测试的数据 该存储库包含摘要数据表和我们用来处理它们的脚本。 受控距离 包含针对每个CONSULT,Kraken-II,CLARK,CLARK-S和Bowtie的每个bin计算的召回和误报信息。 它是的输入,以生成图2a中所示的曲线。 包含用于工具性能比较的CONSULT,Kraken-II,CLARK,CLARK-S和Bowtie的运行时间和内存数据。 该表用作的输入,以生成图2b中所示的条形图。 新型基因组 包含针对默认数据库(针对GTken,TOL和Kraken和CONSULT工具的Bac / Arch Kraken数据库)使用默认参数搜索的每个GORG样本的匹配读取百分比。 它是在图3a上生成ECDF曲线的输入。 , 和保持在变量设置下针对GTDB,TOL,Bac / Arch Kraken数据库查询的GORG数据集的平均召回率和假阳性值。 这些