PADME:这是一个包含我的硕士论文研究源代码的存储库有关使用深度学习预测药物 靶标相互作用 Source code learning

PADME:基于深度学习的药物-靶标相互作用预测框架 这是包含我的硕士论文研究源代码的存储库,即使用Deep Neural Networks预测药物与靶标的相互作用。 PADME名称代表“蛋白质和药物分子相互作用原理”,它也恰好是《星球大战前传》三部曲中的女主角。 可以在这里找到该论文: : 当前,它取决于2017年11月发布的DeepChem Python软件包的版本。我需要对它进行重大修改,以便在处理完本白皮书的第一个版本后,它可以与当前版本的DeepChem兼容。 dcCustom文件夹是一个程序包,继承了DeepChem的某些类。 一些实现是自定义的,因此我将其命名为dcCustom,这意味着“ DeepChem的自定义版本”。 顶层的Python脚本driver.py负责调用dcCustom函数以执行程序。 我假设使用Linux系统, .sh文件调用driver.py ,