Genie:验证和处理GENIE文件 源码

AACR项目GENIE 介绍 该存储库记录了用于收集,质量控制,标准化和分析由AACR的GENIE项目(基因组学,证据,瘤形成,信息,交换)参与的机构上传的数据的代码。 依存关系 这些是您将需要的工具或软件包,能够再现以下结果: Python 3.6或更高版本 Synapse( pip install synapseclient ) Python( pip install pandas ) 文件验证器 pip install aacrgenie genie -v 这将安装所有必需的组件,以便您在所有文件(包括Synapse客户端)上本地运行验证器。 请查看帮助以查看如何运行验证程序。 genie validate -h genie validate data_clinical_supp_SAGE.txt SAGE 发展 版本控制 根据语义版本更新的版本。 将后缀-dev用于开发分支版