Prepare_data_for_3D_MAPs 源码

Prepare_data_for_3D_MAPs 这些脚本从细胞和细胞核的3D二值图像中提取形态测量值,并将其准备为MATLAB文件。 这些代码是由Tomer Stern和Ankit Agrawal编写的。 要了解3D MAP,请阅读。 系统要求 支持Linux,Windows和Mac OS运行该代码。 这些脚本是使用MATLAB版本R2016b编写和编译的,并且依赖于MATLAB工具箱“统计和机器学习工具箱”。 它们至少需要4GB RAM,但是主要在带有Windows 10和512GB RAM的工作站上进行了测试。 安装 此过程应少于10分钟。 安装MATLAB版本2016b或更高版本。 从该存储库下载文件。 您可以通过克隆存储库或将其下载为ZIP文件夹来执行此操作。 解压缩文件夹并运行。 创建(Surfaces).mat文件 该脚本将3D二进制tif图像转换为(Surface