AutoDock GPU:适用于GPU和其他加速器的AutoDock 源码
AutoDock-GPU:适用于GPU和其他加速器的AutoDock 关于 OpenCL和Cuda加速版的AutoDock4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。 OpenCL版本是与TU-Darmstadt合作开发的,能够针对CPU,GPU和FPGA架构。 Cuda版本是与Nvidia合作开发的,以便在Oak Ridge国家实验室(ORNL)峰会上运行AutoDock-GPU,其中包括Jubilee Development公司的Aaron Scheinberg开发的批量配体管线。 引文 使用GPU和基于梯度的本地搜索加速AutoDock4, 2021,10.1021 / acs.jctc.0c01006 查看 特征 基于梯度的本地搜索方法(例如ADADELTA),以及AutoDock 4中Solis-Wets的改进版本。 它针
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Overall,AutoDock-GPUisavaluableadditiontothefieldofcomputationalchemistryandanimportanttoolforacceleratingdrugdiscoveryresearch.
Whileitmaynotbesuitableforallresearchapplications,thoseworkingwithsmallmoleculesandproteinsshouldconsidergivingitatry.
Theprogram'sspeedandaccuracyhavebeenvalidatedthroughnumerousscientificpublicationsandcitations.
Whileitdoesrequiresomeinitialsetup,thebenefitsofusingAutoDock-GPUarewellworththeeffort.
Withitsabilitytohandlelargedatasetsquicklyandefficiently,AutoDock-GPUhasthepotentialtorevolutionizethefieldofdrugdiscovery.
Thesoftwareiseasytoinstallanduse,evenforthosewithoutextensivecomputationalexperience.