sGES figures 源码

用于在“基于蛋白质结构的基因表达特征”中生成图形的代码 Rahman,R等。 2021年,PNAS 指示 要从文章中生成图,您可以在交互式R会话期间运行在每个目录中找到的脚本,其中脚本的每一行都发送到R终端。 每个图形的每个脚本都是独立的,可以单独运行。 但是,所有脚本都需要填充图形目录中的数据目录。 此存储库中包含一些实用程序脚本,用于解析GTEx数据或在R中创建和训练自动编码器。 该代码已经过验证,可以在以下平台上运行:Ubuntu 20.04 LTS,Ubuntu 18.04 LTS和适用于Linux的Windows子系统。 您的里程可能因其他平台而异。 资料目录 所有代码都引用了figures/data/目录这是一个目录,其中包含用于生成图形的数据。 由于所生成数据的大小(> 4GB),该存储库中未包含该数据,但可以从此处下载: : 请解压缩文件,然后将文件夹放置到f