pori_cbioportal:cBioportal适配器用于在IPR中创建PORI报告 源码

PORI c生物门 该库是一部分。 该python软件包使用IPR和GraphKB PORI适配器从cbioportal数据转储中创建PORI报告。 入门 通过点子安装 pip install pori_cbioportal 下载研究数据 研究数据应从cbioportal下载,例如 wget https://cbioportal-datahub.s3.amazonaws.com/laml_tcga_pan_can_atlas_2018.tar.gz tar -xvzf laml_tcga_pan_can_atlas_2018.tar.gz 产生报告 然后将其用于生成研究中所有患者的个人报告。 请注意,您需要同时访问用于匹配的GraphKB服务器和用于上载的IPR服务器。 pori_cbioportal acc_tcga_pan_can_atlas_2018 \ acc_tcga