植物mRNA Poly(A)站点建模:软件设计与实现

一个称为Poly(A)Site Sleuth(PASS)的程序,即在这里介绍的,已经被开发用来预测poly(A)位点的植物信使RNA。 该算法是基于广义隐马尔可夫模型(GHMM)及其特征拟南芥基因组序列和表达的序列标签。 直到最近,植物mRNA poly(A)位点仅从生物实验。 这是因为保护很少腺苷酸化信号和复杂的替代聚(A)位点用法,使基因表达的建模复杂化过程。 利用最新的发展趋势生物学,数学和信息学的跨学科领域PASS程序已成功应用计算机识别解决生物学问题的模型和算法。