Cryo RAlib 源码

Cryo-RAlib-在cryo-EM中加速对齐 这是一个包含gpu加速的多参考对齐代码的存储库,用于冷冻EM图像处理。 该代码在2020 NCHC GPU Hackathon中使用。 团队成员:,,,,统计科学研究所,中央研究院 导师:Nvidia的Ryan Jeng 多参照比对(类别平均值) 无参考对齐(前10次迭代的平均值) 基准 多参考对齐我们比较了EMAN2的CPU实现,并使用了Ribosome 但下采样至90像素。 下表在 c.super实例上运行。 xr , yr , ou , maxit分别设置为3、3、36、6。 加速比为22x〜37x,具有不同的参考编号。 无参考对齐 下表在 c.super实例上运行。 ts , ou , maxit分别设置为1,36,6。 加速速度为2.4x〜9.4x,具有不同的2D偏移。 如何使用图书馆 1.安装 安装EMAN2和Sp