bvcn binder lesson1 源码

活页夹 最初是从分叉的。 感谢出色的团队! :) 演练(具有两个同源序列的种间示例) 输入第一个目录 cd interspecies_example// 对齐FASTA氨基酸文件 muscle -in MNBX01000583.1_4.faa -out MNBX01000583.1_4.fa 根据肽的比对和核苷酸序列进行密码子比对 pal2nal.pl MNBX01000583.1_4.fa MNBX01000583.1_4.ffn -output fasta > MNBX01000583.1_4.codonalign.fa 检查codeml.ctl文件中是否有正确的输入/输出文件 less codeml.ctl 运行代码 codeml codeml.ctl 演练(具有来自一个基因组的三个基因旁系同源物的种内示例) 输入第二个目录 cd intraspecies_example/ 对