epidecodeR 源码

EpidecodeR epidecodeR,一种R包,能够整合从大量表观基因组学或表观转录组学技术(例如ChIP-seq,ATAC-seq,m6A-seq等)产生的DNA / RNA表观遗传数据,以及以差异基因表达的形式失调的基因列表,核糖体占有率或蛋白质差异翻译,并识别由于与基因相关的不同程度的DNA / RNA化学修饰而导致基因失调的影响。 epidecodeR生成累积分布函数(CDF)图,该图显示了基于与基因相关的修饰程度将基因分为几组之间的总体log2FC趋势的变化。 该工具还测试基因组之间log2FC差异的显着性。 安装步骤#建议在安装R和Rstudio之后在Rstudio中运行以下步骤 安装R 选择离您最近的CRAN镜像( ) 安装Rstudio#推荐但不是必需的 为您的操作系统安装Rstudio( ) 安装安装epidecodeR及其依赖项所需的biocondu