domainfacts:统计检测谱系环境和病原体相关蛋白结构域家族 源码

领域事实 统计检测谱系,环境和病原体相关蛋白结构域家族 DomainFacts是对Pfam域家族进行预先计算的分析的数据库。 在Pfam v。32.0中检查了所有17,929个家庭的丰富程度: NCBI(通过Pfam的数据库) 环境(人的肠道,海洋,土壤) 分类谱系 病原与非病原 此外,对所有Pfam系列进行了分析以预测: 使用phylocorrelate.uwaterloo.ca在整个生命树中同时存在的基因家族(仅细菌家族) 确定结构的可行性 网络服务器 可以从以下获得用于探索我们的预测的交互式数据库: : 分析和源代码 分析脚本位于/ scripts /中 RShinyApp Web服务器的源代码位于/ server /中。 作者 Briallen Lobb,Benjamin Tremblay和Andrew Doxey(doxey.uwaterloo.ca)