Data_Integration_Exercise 源码

Data_Integration_Exercise 初始大纲: Biol722小组研讨会 Meagan Archer Meghan Pepler Sreedevi Kesavan Stephanie Ali Fairbairn 将RNA-seq与ChIP-Seq整合 我们的模型系统简介(可能来自Elliot实验室的数据-将WT与突变菌株进行比较)RNA-seq管道的简要概述我们有计数表-现在呢? 缩小感兴趣的差异表达基因的范围ChIP-seq工作流程简介处理ChIP-Seq数据将RNA-seq数据与ChIP-seq整合在一起(我们可能会在本研讨会上重点研究转录因子,但是可以使用相同的过程分析染色质调节剂的ChIP数据)以预测转录因子是否具有激活或抑制功能推断转录因子的靶基因(转录因子对差异表达基因的直接或间接作用)降低假阳性率可能(有时间允许)找到结合位点的序列基序靠近上调或下调的靶