biol 4386 course project Jia Zhao1998:GitHub Classroom创建的biol 4386 course projec

分析酿酒酵母中的转录因子Pho4结合位点和核小体的占有率。 这是针对BIOL:4386:2021年Spring科学计算入门课程的。此存储库旨在跟进C16核小体占用计划(Bin He Lab),并改编自Bin He的存储库 简介/背景 酿酒酵母或酿酒酵母( S. cerevisiae )是面包酵母,与第二大常见酵母菌病原假丝酵母或光滑假丝酵母密切相关。 他们超过90%的基因是一对一的直向同源物,但是这两个物种占据着不同的生态位:酿酒酵母主要与植物和土壤相关,并已被人类驯化为发酵和熏制食物。 尽管在土壤和植物中也发现了光滑念珠菌,但它与前者的不同之处在于,它能够定居人类宿主并在免疫系统受损的患者中引起感染。 光滑念珠菌在宿主环境中生存的主要挑战之一是适应压力的独特模式,例如宿主免疫细胞的攻击。 鉴于它们的基因含量相似,我们假设应激React网络的重新布线在这种适应中起着重要作用。 为了更好地