cancer trial match:派生用于癌症临床试验的数据以及Web查看器以可视化结果 源码

癌症试验比赛 这些文件可获取用于癌症临床试验的数据,以及用于查看结果的Web查看器。 同义词(在Clinicaltrials.gov condition.name字段中指定的癌症类型)和受控癌症类型之间的映射由conditionSynonyms4.csv文件指定。 人类基因及其同义词列表可从下载 脚本trialMatchDataRefresh.Rmd会生成数据-建议每天运行此脚本,以确保数据尽可能保持最新。 使用脚本TRIAL_MATCH_SHINY.Rmd可以摄取和可视化数据。 该文件trialMatchConfiguration.json包含配置详细信息-Clinical Trials Transformation Initiative帐户的用户名和密码,并且需要在运行之前将Web浏览器的联系电子邮件添加到该文件中。