rust bio tools:基于Rust Bio的一组命令行实用程序 源码

Rust生物工具 一套基于Rust-Bio的超快速和强大的命令行实用程序,用于生物信息学任务。 Rust-Bio-Tools提供了一个命令rbt ,该命令当前支持以下操作: 两个vcf / bcf文件的模糊匹配的线性时间实现( rbt vcf-match ) 一个vcf / bcf到txt转换器,可灵活地选择标签并正确处理多等位基因位点(rbt rbt vcf-to-txt ) 线性时间轮询FASTQ拆分器,用于将给定的FASTQ文件拆分为给定数量的块( rbt fastq-split ) 在给定的基因座( rbt bam-depth )下,从BAM提取深度信息的线性时间 一个实用程序,可以从FASTQ文件中快速过滤记录( rbt fastq-filter ) 使用标记的重复项(分别是唯一的分子标识符(UMI))将BAM或FASTQ读数合并的工具(rbt rbt collaps