htslib:高通量测序数据格式的C库 源码

HTSlib是用于访问常见文件格式(例如的统一C库的实现,该文件格式用于高通量测序数据,并且是和使用的核心库。 HTSlib仅取决于 。 已知与gcc,g ++和clang兼容。 HTSlib实现了通用BAM索引,其文件扩展名为.csi (坐标排序的索引)。 HTSlib文件阅读器首先查找新索引,然后在缺少新索引的情况下查找旧索引。 该项目还包括流行的tabix索引器和bgzip压缩实用程序,该索引器同时对.tbi和.csi格式进行索引。 构建HTSlib 有关完整的详细信息,请参见 。 包含尚未提交到此存储库的生成文件,因此从Git存储库构建代码需要额外的步骤: autoreconf -i # Build the configure script and install files it uses ./configure # Optional but recommende