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tree_move_examples 源码

上传者: 2021-04-07 15:08:09上传 ZIP文件 5.54MB 热度 8次
用于在树移动示例上测试UShER。 运行python makeTreeMoveTestExamples.py 来产生一组2个与给定示例相对应的fasta文件,其中一个文件的所有样本都位于初始树中,一个文件中的所有样本都将添加。 示例文件应遵循以下格式: 面积S1 m1,m2,m3 S2平方米S3 m1,m3,m4,m5 S4 m1,m2,m3,m5,m6 S5 m1,m3,m5,m6 S6 m1,m5,m6 S7 m5,m6 S8 m6 等,以?结尾的突变转换为代表参考或替代的IUPAC。 我一直遵循此协议: 首先,像上面的一样创建一个example
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