Sepsis diagnosis from pairwise single cell RNA Continued 源码

从成对单细胞RNA进行败血症诊断 存储与此项目有关的所有相关代码。 数据预处理 -请检查“数据预处理”文件夹。 readdata.py包含数据预处理阶段的相关代码。 changefdrlimit.py在实验过程中更改Fdr阈值。 deleteSparseData.py会在实验期间更改稀疏阈值。 read_specgenes.py选择特定基因与其他生物标记进行比较。 模型训练 3s_series_trTran_CNN包含我们在课程中选择的模型的相关代码。 (Transformer + CNN,ESTR3108) NEW_NEW_capsnet.ipynb包含我们最新模型的相关代码。 (CapsuleNet +变压器) 型号比较 文件夹“ OTHER_MODELS”显示了我们训练用于比较的其他模型。 (可能包括相同的模型,但参数不同) 结果 屏幕截图和用于评估模型的图形位于“结果”文件夹中。