基因路径:确定装配体中的基因顺序和方向 源码

基因途径 确定装配体中的基因顺序和方向。 要求 C ++编译器 BLAST +套件( blastn , makeblastdb ) 安装 cd src && make && make test 用法 gene-paths --help gene-paths -g examples/assembly.gfa -f examples assembly.fna -q examples/query1.gfa 背景 动机 开发这些工具是为了帮助回答以下问题:“基因相对于哪里?” 例如,在键入金黄色葡萄球菌SCCmec盒时,IS431是在mecA基因的上游还是下游以及是否反向是很重要的。 如果特征在基