ml course project:医学生物信息学2020课程的机器学习项目工作 源码

毫升课程计划 用于2020年医学生物信息学机器学习个别课程项目分配的回购协议。 描述 在此项目中,目标是将各种机器学习(ML)方法应用于选择的数据集并评估其性能。当我在博士学位研究中使用空间转录组学(ST)时,我决定将此类数据集用于该项目。该工作量应相当于大约一个星期的工作。 在此项目中,我选择将ML应用于一组乳腺癌ST数据集,其中每个数据点(“斑点”)均被标注为癌症或健康,并使用ML来查看是否可以仅使用ML来预测这些标签基因表达数据。 代码 使用Jupyter Notebook的Python 3中的所有代码以及ML方法均来自scikit-learn。为此项目设置了一个envirronment.yml环境,可以使用envirronment.yml文件安装该环境。 数据 我获得了在我们研究小组( )中产生的数据的访问权限,其中包含来自乳腺癌组织切片的几个ST数据集。数据是Alma Ande