scito:在Jupyter笔记本电脑中进行SCITO seq分析的PythonC packade 源码

SCITO-seq:单细胞组合索引细胞术测序 打包以部署在无服务器Lambda上。 潜在的集装箱化。 无服务器计数管道的结构(SCITO计数) 用户在进行任何处理之前将数据上传到S3。 用户创建一个配置文件并将其推送到S3。 Lambda 1:接收S3事件。 将FASTQ文件拆分为1Gb的块。 创建SQS队列并在那里发送字节范围。 创建Lambda 2 。 在S3中创建一个进程名称为0字节的复合触发器文件。 复合触发器应为12个字节以触​​发Lambda 3 。 Lambda 2:并发Lambda。 SQS触发字节范围的下载并创建可充气BGZF块的“内容表”。 监控SQS深度。 如果没有消息,则SQS被销毁并调用Lambda 3 。 Lambda 3:销毁Lambda 2的所有实例。 为样本的每个读取文件提取描述FASTQ文件的BGZF块的内容表。 合并它们并进行重复数据删除。