12SfishClassifier:该存储库包含12S线粒体基因参考集可与RDP分类器一起使用以对鱼类中的12S元条形码序列进行分类 源码

介绍 该资料库包含经过培训的参考集,可与核糖体数据库项目分类器(Wang等,2007)一起使用,以分类分配鱼类12S线粒体基因序列。 可以从下载最新版本。 笔记 该分类器适用于将鱼类12S线粒体基因序列分类为属。 从鱼类的线粒体基因组数据库(MitoFish)获得参考序列,为等人,2018),并检索了12S基因区域的序列。 分类法基于NCBI分类法数据库。 如何引用 如果您在出版物中使用此12S鱼参考集,请在“方法”部分链接到此页面。 还请引用MitoFish数据库,其中提供了线粒体基因组序列: Sato,Y.,Miya,M.,Fukunaga,T.,Sado,T.,Iwasaki,W.,Kumar,S.(2018)MitoFish和MiFish Pipeline:鱼的线粒体基因组数据库,带有环境DNA分析管线元条形码。 分子生物学与进化,35:1553。 如果您将此参考集与RDP分