Shotgun_Microbiome_Bioinformatics 源码

gun弹枪_微生物组_生物信息学 此包含一个我主要基于包装器使用的工作流程,但是它几次使用更新的软件(MetaWRAP现在已经更新了这些)。 总体而言,包装器非常好,而且易于遵循。 此工作流中的某些块可以直接在终端中运行,但是其他一些块则需要大量资源,因此需要提交给HPC。 HPC作业将用(qsub)表示。 我最终将使它适应于在,但是现在它依赖于在HPC节点上安装软件和数据库。