TE_finder:开发了一套C ++程序用于转座子搜索及其在大型真核生物基因组序列中的注释。 REPET包装的一部分 源码

TE Finder 2.29 概述 TE Finder套件收集了为可转座子搜索及其在大型真核基因组序列中的注释而开发的C ++程序。但是我们认为这些工具足够通用,可以在其他情况下使用。 该套件主要由四个程序BLASTER,MATCHER,GROUPER和DUSTER组成。可以通过MATCHER和GROUPER程序进一步处理BLASTER的结果,但是如果将它们的输出正确格式化为a,则可以将这最后两个程序与其他程序(例如RepeatMasker,CENSOR,BLAST,BLAT等)结合使用。 BLASTER输出文件(即* .align)。请参阅说明 这些二进制文件是一部分。 货柜 奇点图像在可用 您只需输入以下内容即可运行: -如果图像是本地下载的,请键入: $ singularity run te_finder2.29.sif blaster2.29 -h -如果映像是远程映像,请键