MLLAF4 GRN_paper_2021 源码

对MLL-AF4基因调控网络的表型分析表明,间接CASP9抑制是诱导细胞凋亡抗性的一种方式 该存储库包含用于关键代码片段,。 所有脚本都是用R编写的jupyter笔记本。 01_Build_Network.ipynb-用于创建基因调控网络模型的脚本和工具。 02_Annotate_GRN.ipynb-使用集中度计算和其他数据集的基本GRN模型的注释。 03_NetworkPlot.ipynb-绘制网络,如发布中所示。 04_Stress_FC_analysis.ipynb-在计算机节点微扰后,用于应力倍数变化计算的方法。 05_Patient_Sub-networks.ipynb-用于生成患者子网的方法。