基于最小二乘距离的RNA结构基序识别

RNA结构基序是出现在RNA分子中的循环结构元件。 RNA结构基序识别旨在寻找与查询基序相似的RNA亚结构,这对于RNA结构分析和RNA功能预测很重要。鉴于此,我们提出了一种基于最小二乘距离(LS-RSMR)的称为RNA结构基序识别的新方法,以有效识别RNA结构基序。我们编写了由在大肠杆菌核糖体RNA中出现的五种类型的RNA结构基序组成的测试集。进行了识别这五种图案的实验。实验结果充分显示了与其他四种最新方法相比,所提出的LS-RSMR的优越性。