MS2Planner:通过迭代数据采集优化基于串联质谱的代谢组学的研究范围 源码

MS2计划器 输入 它使用从convert_to_table生成的特征表和原始信号.mzTab(曲线模式)作为输入。 输出 它以.txt格式输出最佳路径,path_finder.log是日志文件。 跑 python path_finder.py mode infile outfile intensity_threshold intensity_ratio num_path -infile_raw -intensity_accu -win_len -isolation -restriction -delay -min_scan -max_scan 保留时间的单位是秒(秒),质荷比是道尔顿(Da)。 mode : apex或baseline或curve apex模式使用顶点文件并应用路径查找算法来查找最佳路径。 baseline模式只是将保留时间分成几个小窗口,窗口的长度由win_len