KRSA_App 源码

KRSA Kinome随机采样分析仪(KRSA)是R Shiny应用程序,可自动执行分析数据集所需的许多步骤,包括肽过滤,随机采样,热图生成和激酶网络生成。 这款新软件使分析kinome数组数据集变得可访问,并且消除了以前方法所需的许多人工工作量。 更重要的是,KRSA通过可视化改变的kinome信号网络而不是单个激酶来代表更大生物学背景的结果。 有关PamStation12平台的更多信息,请参见: 使用权 该Web应用程序可在此处免费访问: KRSA R软件包仓库: KRSA预印本位于: 工作流程 输入文件 选择用户提供的激酶-肽关联文件和原始激酶组数据文件作为输入。 激酶-肽的关联应基于在GPS 3.0和Kinexus Phosphonet等数据库中发现的已知/预测的相互作用。 预期输入的格式应如示例文件中所示:data / datasets / DLPFC_MvsF_STK.