hh suite:远程蛋白质同源性检测套件 源码

HH-suite3用于敏感序列搜索 (C)约翰内斯·索丁,马库斯·迈耶,马丁·斯坦纳格,米洛·米尔迪塔,迈克尔·雷默特,安德里亚斯·豪瑟,安德里亚斯·比格特 HH-suite是一个开放源代码软件包,用于基于隐马尔可夫模型(HMM)的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。 文献资料 我们提供了一个详尽的,其中包含许多用法示例,常见问题解答和用于构建自己的数据库的指南。 安装 还可以通过下载静态编译的版本或来安装HH-suite3。 HH-suite3需要64位系统(使用uname -a | grep x86_64检查)。 在AMD / Intel CPU上,它至少需要支持SSE2指令集(通过在Linux上执行cat /proc/cpuinfo | grep sse2或在macOS上执行sysctl -a | grep machdep.cpu.features | grep SSE2进行检查)。 与SSE2相比, AVX2速度大约快2倍。 HH-suite3还可以在具有ARM64和PPC64LE CPULinux系统上使用。 可在找到所有受支持系统的预编译二进制文件。 # install v