fastqcs3:CHEM E 545546最终项目的主要回购 源码

FastQCS3:16S基因测序的快速定量检查 CHEM E 545/546最终项目的主要回购 概述/目的 该软件的目的是为用户提供一种工具,可在测序结果可用后立即快速运行质量检查。 该软件将设计为可从命令行运行的python可安装软件包。 通过模块化设计,用户将有机会指定他们要执行哪种FastQCS3。 安装依赖项 该软件包依赖于先前发布的微生物组分析软件包来预处理输入数据并提供测序质量指标。 FastQCS3寻求利用QIIME2数据处理功能,同时着重于构建一个交互式仪表板,该仪表板具有比QIIME2的.qza格式更有用的可视化工具。 为了能够使用FastQCS3,必须首先安装QIIME2。 安装Miniconda 您可以按照的说明安装Miniconda。 更新迷你conda conda update conda 安装wget conda install wget 如果conda