女皇:用于微生物组数据分析的快速可扩展的系统树浏览器 源码

皇后 介绍 Empress是一种快速且可扩展的浏览器,可帮助交互式地探索数据集中要素之间的层次关系。 从历史上看,这些特征通常在社区调查中代表物种的进化关系,并以它们的系统发育或遗传相似性/差异为特征,但实际上,您可以按层级组织查看任何类型的信息。 例如,您可以查看从16S rRNA标记基因测序数据生成的树,或使用 ( )LC-MS数据的代谢树。 Empress支持分类的新功能,例如动画和与排序图的集成,以及已建立的树查看器共有的功能(例如,元数据着色,分支折叠和条形图)。 截屏 “帝国图”在Empress(左)中可视化扩增子序列变异(ASV)的系统发育树,在Emperor(右)中显示