transcriptomic_snakes:蛇形管道的演示 源码

transcriptomic_snakes 蛇形管道的演示 设置conda: 设置snakemake: 克隆此git,确保$ PATH中有可用的snakemake并运行: snakemake --cores 8 --use-conda 从./transcriptomic_snakes/内部,第一次运行需要更长的时间,因为需要设置R。 当满足所有要求后,替换1_Reads目录中的单端读取基因组.fna和genes.gff,运行 sh cleanup.sh 接着: snakemake --cores 8 --use-conda 该管道要求您在具有conda和snakemake设置Linux环境中,没有其他要求。 运行管道后,所有结果都可在5_Results /目录中找到。