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partie:PARTIE是一个程序用于将序列读取档案(SRA)宏基因组学数据划分为扩增子和shot弹枪数据集。 用户提供的数据集注释不可信因此PARTIE允许

上传者: 2021-03-19 09:59:44上传 ZIP文件 19.91MB 热度 4次
派对 PARTIE是将序列读取档案(SRA)宏基因组学数据划分为扩增子和shot弹枪数据集的程序。 用户提供的数据集注释不可信,因此PARTIE允许自动分离数据。 PARTIE对数据进行子采样,测量与序列相关的几个不同参数,并使用这些参数基于经过训练的随机森林对序列进行分类。 当前,PARTIE根据以下数据对数据进行分类: percent_unique_kmer:序列的百分比由唯一的k -mers表示 percent_16S:与16S基因相似的序列百分比 percent_phage:与噬菌体基因相似的序列百分比 percent_Prokaryote:与原核基因(来自细菌和古细菌的基因)相
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