scope9 源码

6mA范围 描述 6mASCOPE是使用定量反卷积方法评估真核物种中6mA事件的工具箱。 通过在PacBio测序Sequel II系统上使用新颖的短插入文库(200〜600bp)设计,6mASCOPE有效地利用了大量的圆形共识(CCS)读数来可靠地捕获单分子分辨率下IPD值的偏差。 采用创新的宏基因组学方法,6mA SCOPE将来自gDNA样品的DNA分子解卷积为感兴趣的物种和基因组区域以及污染源。 使用合理设计的机器学习模型,6mASCOPE可以对每种反卷积成分进行灵敏而可靠的6mA定量。 使用权 当前版本供稿件审阅。 发布后,我们计划在我们的GitHub页面上公开发布6mASOCPE。 安装 6mASCOPE作为全功能映像分发,无需安装除虚拟化软件以外的任何依赖项。 我们建议使用Singularity,它可以安装在Linux系统上,并且通常是HPC管理员首选的解决方案()。 6mASC