GFP细胞检测 源码

GFP细胞检测 运行脚本“ sh run_script.sh $ brainID”以获取结果。 本文的代码回购: Sukhendu Das,Jaikishan Jayakumar,Samik Banerjee,Janani Ramaswamy,Venu Vangala,Keerthi Ram和Partha Mitra。 BioRxiv(2019):252247。 构型 将输入的Brain图像以JP2格式存储,并在带有BrainID的文件夹中的名称中包含字母F(代表荧光部分)。 如果您有“脑区域分割”(如.mat文件),请将其存储在文件夹$ brainID / reg_high_seg_pad /中 如果您有其他格式的“脑区域分割”,请正确阅读该分割,以使其代表GFP_Cell_Detection / main_bam.m的第28行中的单通道图像 如果没有“脑区域分割”,请注释掉GF