swabseq:UCLA Swabseq软件 源码

UCLA扩增子定量软件,用于分析SwabSeq Sars-CoV-2测试中的扩增子数据 将脚本的BCL和XLSX描述转换为每个扩增子计数表的脚本,请参见 查看以了解特定于运行的分析脚本 看到的BCLS,gzip压缩fastqs和扩增计数表制定的实验 每次测序运行的统计信息和注释: 跑 仪器 笔记 观察到的PhiX 指定的PhiX百分比 浓缩已加载(pM) 簇密度 簇PF(%) 下一序列 -- 17.6 50 1.4 pM 170K / mm2车道1和2 115车道3和4 80%PF 下一序列 -- 19.5 40 1.4 pM 155K / mm2 91%PF 下一序列 -- 23 50 1.5 pM 160K /平方毫米 75%PF 下一序列 -- 50.4 40 1.5 pM 180K /平方毫米 73%PF 下一序列 -- 55