mph:MINQUE用于分区遗传力 源码

MPH:MINQUE用于分区遗传 MPH旨在将SNP遗传力与相关样品的基因型或大跨度LD分开。 对于此类数据,LDSC,HE或MQS效果不佳。 MPH在准确性方面可与GREML相媲美,但速度更快。 它可以处理类似DYD的数据。 它适用于许多重叠的功能注释。 软件下载 示例:QTL-MAS 2012数据 有关如何模拟数据集,请参阅 。 有关数据格式,请参阅 。 MPH更喜欢Plink bim / fam / bed文件作为基因型。 其他输入文件大多是CSV。 SNP信息文件 该CSV文件对于构建基因组关系矩阵(GRM)至关重要。 每列对应一个GRM。 在示例数据中,有五个列代表五个染色