LiteQTL.jl 源码

LiteQTL LiteQTL是一个利用GPU的计算能力几乎实时运行全基因组QTL扫描的软件包。 LiteQTL使用新算法,可以对多达一百万个特征进行近实时全基因组QTL扫描。 通过使用易于并行化的运算(包括矩阵乘法,向量化运算和逐元素运算),我们的方法比使用16个线程的R / qtl线性模型基因组扫描快300倍。 纸: 要了解有关使用的方法以及加速技术的更多信息,请参阅我们关于Biorxiv的论文: 切尔西·特罗特(Chelsea Trotter),金贤eon(Hyeonju Kim),格里高里·法拉格(Gregory Farage),约瑟夫·普林斯(Pjotr​​ Prins),罗