phageParser:一个从开放遗传数据中提取CRISPR信息的项目 源码

噬菌体分析仪 phageParser是一个从开放遗传数据中提取和组织CRISPR信息的项目。 来和我们聊天吧! 这是什么工具? 已经对许多细菌和古细菌基因组进行了测序,,范围从致命的人类病原体到生活在地球上最恶劣环境中的古细菌。 已经对某些CRISPR系统进行了很好的研究,并且每天都在发现有关CRISPR的更多信息。 phageParser是一种工具,用于收集不断增长的信息并生成通用且有用的注释。 这些是我们包括的一些注释: 垫片与已知的噬菌体和噬菌体相匹配 间隔匹配附近的噬菌体基因组含量 间隔子自我匹配以宿主基因组 cas基因含量和推断的CRISPR类型 我们将在数据库中收集这些注释,用户可以通过GUI(图形用户界面)进行查询。 这些都不存在,我们正在寻找贡献者! 该工具目前正在开发中,随着CRISPR研究的进展,将始终可以修改和增强其功能。 我们欢迎您提供有关功能或注释的建议!