antsnap:通过蚁群优化进行上位挖掘 源码

蚂蚁 antsnap是一种用于检测全基因组关联研究数据中上位相互作用的方法。 该项目建立在先前的方法上,这些方法使用蚁群优化来识别上位性相互作用,但是相反,它试图识别3-SNP相互作用。 结果有时是好的,但是最终尝试搜索如此大的空间是相当困难的,并且可能无法替代更详尽的搜索方法。 当然,这种方法也有可能得到显着改进。 目前,此代码是为与GAMETES 2.0模拟的GWAS数据配合使用而编写的,其格式如下: N1 N2 N2 MOP1 MOP2 MOP3 Class 0 2 1 2 2 2 0 0 2 0 1 0 2 1