sita_eisa 源码

使用EISA的SITA分析管道 使用选定实验条件的外显子-内含子分裂分析(EISA)进行成对比较可视化和应力诱导转录衰减(SITA)分析的管道。 该管道使用编写,并具有Python和R脚本,适合与HPC系统一起使用。 目录 待定 背景 SITA是在压力诱导后细胞中快速诱导的过程,引起全局转录变化,其中下调的基因比例远大于此过程中上调的基因比例。 待定 <<<<<<< HEAD 建立 剧本 待定 目录结构 由于该管道旨在在每次运行时处理单个GSE的所有选定SRR / GSM,因此当前有必要遵循以下目录体系结构。 每个GSE都有一个单独的文件夹,其中包含S