EToKi:与Enterobase相关的所有方法 源码

EToKi(Enterobase工具套件) 所有与Enterobase数据分析管道有关的方法。 安装: EToKi是在Python 2.7和Python 3.5中开发和测试的。 EToKi依赖于几个Python库: ete3 numba numpy pandas sklearn 可以使用pip安装所有库: pip install ete3 numba numpy pandas sklearn EToKi还针对不同的管道调用以下第三方程序: raxml fasttree rapidnj bbmap mmseqs ncbi-blast usearch spades megahit sam